A restrikciós térképezés egy top-down stratégia, amely a kromoszóma célját finomabb régiókra osztja. A korlátozó enzimeket arra használják, hogy egy kromoszómát emészthessenek, és rendezett DNA fragmentumokat állítsanak elő. A könyvtárban lévő klónozott fragmentumok helyett a célkitűzés genomi fragmentumait foglalja magában. Rögzítésre kerülnek a genomi könyvtár szondain, amelyeket véletlenszerűen választanak ki a detektálási célhoz. A fragmensek hosszát electrophoresis -nel mérjük, amelyek alapján kiszámíthatjuk távolságukat a térkép mentén a korlátozási hely, a fizikai térkép markerei szerint. A haladás kombinatorikus algoritmusokat foglal magában.
A folyamat során egy hibrid sejtből kromoszómát nyernek, és a ritka korlátozási helyre vágják, hogy nagy fragmentumokat állítsanak elő. A fragmenseket méret szerint választják el és hybridization -ig megrajzolják, így képezik a makrokorlátozási térképet és a különálló összefüggő blokkokat (azaz a Contigs-t). A fragmensek összekapcsolásának biztosítása érdekében a nagy fragmentumoknál ugyanazon ritka vágási helyekkel összekötő klónokat lehet használni.
240A. Kép A Perturb-seq munkafolyamat áttekintése Sdlee94 / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Overview_of_Perturb-seq_workflow.jpeg) from Wikimedia Commons
Szerző : Milos Pawlowski
Megjegyzések
Megjegyzés küldése