A NChIP fő előnye az ellenanyag-specifitás. Fontos megjegyezni, hogy a módosított hisztonokkal szembeni legtöbb antitest antitestek nem rögzített, szintetikus peptid antigének ellen képződnek, és hogy a XChIP -ben megtalálható epitópok megsemmisíthetők vagy megsemmisülhetnek a formaldehid-keresztkötések révén, különös tekintettel a keresztkötések kialakulására. valószínűleg lizin-e-aminocsoportokat von be az N-terminálisokba, megbontva az epitópokat. Ez valószínűleg magyarázza a XChIP protokollok általában alacsony hatékonyságát a XChIP NChIP -hez képest.
De a XChIP és NChIP célok és előnyök hasonlóak egymással szemben. XChIP a másoló faktorok és más kromatinnal társított fehérjék objektív helyeinek feltérképezésére szolgál; NChIP a histone módosítók objektumainak helyének feltérképezésére szolgál .
Előnyök
XChIP
Alkalmas transzkripciós faktorokhoz vagy bármely más gyengén kötő kromatinnal társított fehérjéhez. Minden olyan szervezetre alkalmazható, ahol a natív fehérjét nehéz előállítani.
130A. Kép ChIP-sequencing munkafolyamat | Jkwchui / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Chromatin_immunoprecipitation_sequencing.svg) a Wikimedia Commonsból
Szerző : Milos Pawlowski
Megjegyzések
Megjegyzés küldése