DRIP-seq A -ot természetesen az R-hurkok genomszintű feltérképezésére használják. A R-loop képződési helyek azonosítása lehetővé teszi a különféle sejtes események tanulmányozását, amint azt a R-loop képződés szolgálata egy adott régióban, ezeknek a régióknak a jellemzése és a gén expressziós formájára gyakorolt hatás mutatja. Hasonló módon felhasználható az R-hurkok befolyásának tanulmányozására más folyamatokban, mint például a DNA replikáció és szintézis. Közvetett módon DRIP-seq végrehajtható mutáns sejtvonalakon, amelyek hiányosak a R-loop -ben részt vevő génekben R-loop felbontás. Az ilyen típusú vizsgálatok információt szolgáltatnak a mutáns gén szerepéről a DNS-RNS képződés visszaszorításában, és potenciálisan pontosítják az R-hurkok jelentőségét a genom instabilitásában.
DRIP-seq Az -et először az R-hurok genom szintű profilozására használták az emberekben, ami széles körben elterjedt R-loop képződést mutatott a CpG-sziget promótereknél. Konkrétan, a kutatók azt találták, hogy a R-loop képződése a CpG-szigetek nem metilezett állapotával jár.
DRIP-seq A -ot később felhasználták a R-loop képződés profilozására a humán pluripotens Ntera2 sejtek kezdő és befejező helyének másolásánál. Ebben a tanulmányban a kutatók kiderítették, hogy a gének 3'-végén lévő R-hurkok összefüggésben lehetnek a másolás lezárásával.
156A. Kép R-loop és S9.6 monoklonális antitest | Kmnip / CC BY (https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:R_loop_S9.6_mAb.svg) a Wikimedia Commonsból
Szerző : Yavor Mendel
Megjegyzések
Megjegyzés küldése