Foszfolinált fluoreszcens nukleotidok vagy valósidejű szekvenálás

A Pacific Biosciences jelenleg vezeti ezt a műveletet. A valós idejű szekvenálás művelete magában foglalja a festékkel jelölt nukleotidok folyamatos beépítésének leképezését a DNA szintézis során: az egyedi DNA polimeráz molekulák az egyes nulla üzemmódú hullámvezető detektorok alsó felületéhez vannak rögzítve. (Zmw detektorok), amelyek konkatenációs információkat szerezhetnek, míg a foszfolinnal kezelt nukleotidokat beépítik a növekvő primer szálba. A Pacific Biosciences egy egyedi DNA polimeráz, amely jobban beépíti a foszfinolizált nukleotidokat és lehetővé teszi a zárt kör alakú sablonok újbóli szekvenciáját. Bár az egyolvasás pontossága 87%, a konszenzus pontosságát 99,999% -ban bizonyították több kilobázisos leolvasási hosszúságokkal. 2015-ben a Pacific Biosciences kiadott egy új szekvenáló műszert, a Sequel System nevű szekvenáló műszert, amely körülbelül 6,5-szeresére növeli a képességet.

DNA keverés

DNA A megkeverés egy módja annak, hogy a hasznos mutációk gyorsan terjedjenek egy irányított evolúciós kísérletben. A DNA könyvtár méretének gyors növelésére használják .

Eljárás

Először a DNase -et arra használjuk, hogy egy DNase szülőgént sorozzunk 50-100 bp hosszúságú darabokra. Ezt követi egy polimeráz láncreakció( PCR) láncindítók nélkül - DNA fragmensek, amelyek elegendő átfedésben vannak a homologous konkatenációval, egymáshoz kapcsolódnak, majd meghosszabbítják őket a DNA polimeráz segítségével.

Image 155A | A PacBio SMRT technológia és az Oxford Nanopore változatlanul használhatja a DNA -ot a metilezéshez. | Nivretta Thatra / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:3rd_gen_Epigenetics.png) a Wikimedia Commonsból

Image 155A | A PacBio SMRT technológia és az Oxford Nanopore változatlanul használhatja a DNA -ot a metilezéshez. | Nivretta Thatra / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:3rd_gen_Epigenetics.png) a Wikimedia Commonsból

Szerző : Yavor Mendel

Referenciák:

Molekuláris biológiai technikák

Molekuláris biológia technikái III

Megjegyzések