Különbség a snRNA-seq és scRNA-seq között

Az SnRNA-seq az izolált sejteket inkább a teljes sejtekben használja fel az expresszió génformájának profilozására. Vagyis scRNA-seq mind a citoplazmatikus, mind a nukleáris transzkriptumokat méri, másrészt snRNA-seq természetesen a nukleáris transzkriptumokat méri (bár néhány transzkriptum hatékonysága reticulum hozzátartozik a durva endoplazmatikushoz reticulum, és részben megmarad a nukleáris preppekben). Ez lehetővé teszi, hogy a snRNA-seq csak a sejtmaggal járjon, és nem az egész sejttel. Ezen okból kifolyólag, a scRNA-seq -hez képest, az snRNA-Seq sokkal helyesebb a nehezen izolálható sejtekben (például adipociták, idegsejtek), valamint tartósított szövetekben kifejeződő expressziós génformák profilozására.

Ezenkívül a snRNA-seq -hoz szükséges magokat gyorsan, könnyen meg lehet szerezni friss, enyhén rögzített vagy fagyasztott szövetekből, miközben az egyedi sejtek izolálása az egysejtes RNS-seq( scRNA-seq) kiterjedt inkubációkat és feldolgozást scRNA-seq igényel. Ez felkutatja a kutatókat arra, hogy készítsenek olyan transzkriptómákat, amelyek az izolálás során nem zavarnak.

271A. Kép ​​| Az alapvető snRNA-Seq kísérletek, amelyek nem használnak DroNC-Seq munkafolyamatot, az ehhez hasonló protokollt követnek | Simkrai / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Basic_snRNA-Seq_Workflow.png) from Wikimedia Commons

Szerző : Yavor Mendel

Referenciák:

Molekuláris biológiai technikák II

Molekuláris biológiai technikák VI