Nagymértékben párhuzamos aláírás-szekvenálás (MPSS)

Az első nagy áteresztőképességű szekvenálási technológiát, a nagymértékben párhuzamos aláírás-szekvenálást (vagy MPSS) az 1990-es években fejlesztették ki a Lynx Therapeutics-ben, egy olyan társaságban, amelyet 1992-ben alapítottak Sydney Brenner és Sam Eletr. Az MPSS gyöngy alapú művelet volt, amelynél a complex -nél használták az adapter ligálását, majd ezt követõen az adapter dekódolása, az összekapcsolás négy nukleotid növekményével történõ leolvasása. Ez a művelet érzékenyvé tette a szekvencia-specifikus torzítást vagy a specifikus szekvenciák elvesztését. complex Annak alapján, hogy a technológia ilyen complex, az MPSS-t csak a házon belül hajtotta végre a Lynx Therapeutics, és nem DNA A szekvenáló gépeket független laboratóriumoknak adták el. A Lynx Therapeutics 2004-ben egyesült a Solexa-val (később az Illumina megszerezte), amely a szintetikus szekvenálás fejlesztéséhez vezetett, amely egyszerűbb kéznél van a Manteia Predictive Medicine-től, amely elavulttá tette az MPSS-t. Mindenesetre az MPSS kimenet lényeges tulajdonságai jellemzőek voltak a későbbi nagy áteresztőképességű adattípusokra, beleértve több százezer rövid DNA szekvenciát. Az MPSS esetében ezeket általában a cDNS szekvenálására használták az expressziós szintek génformájának mérésére.

151A. Kép ​​| A többszörös, széttagolt konkatenációs analízist egymással átfedő területeik alapján kell összeállítani. | Felfüggesztés / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) a Wikimedia Commonsból

151A. Kép ​​| A többszörös, széttagolt konkatenációs analízist egymással átfedő területeik alapján kell összeállítani. | Felfüggesztés / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) a Wikimedia Commonsból

Szerző : Milos Pawlowski

Referenciák:

Molekuláris biológiai technikák

A molekuláris biológia technikája II

Megjegyzések